يدار الصندوق بواسطة مجلس إدارة موحد لصندوقي المعاشات والتامين الإجتماعى .
– يرأس وزير الرعاية والضمان الإجتماعى مجلس الإدارة ويضم المجلس في عضويته ممثلين للحكومة ، أصحاب العمل – اتحاد العمال – اتحاد المعاشيين ومديري الصندوقين بالإضافة للخبراء .
– يشتمل الهيكل التنظيمي للصندوق على خمس إدارات عامة تتبع لها عدد من الإدارات وهى :-
(الإدارة العامة للموارد البشرية والمالية – الإدارة العامة للشؤون الفنية والاكتوارية – الإدارة العامة للتخطيط والتطوير – الإدارة العامة لشؤون الفروع وتشرف على (18) فرعا ولائيا – الإدارة العامة لنظم المعلومات) .
– كما يشتمل الهيكل التنظيمي كذلك على إدارات تابعة لمكتب المدير العام وهى :-
(الإدارة القانونية – المكتب التنفيذي – المراجعة الداخلية – العلاقات العامة – استثمارات المعاشيين – الإدارة الهندسية – الشؤون الاجتماعية) .
